Les missions d'un audit financier peuvent être légale et/ou contractuelle. L’audit légal est celui qui exige une désignation par l’assemblée générale de l’auditeur inscrit à la Compagnie des commissaires aux comptes. Il reste toutefois indépendant et il émet son opinion sur les comptes en toute autonomie.L’audit contractuel est plus utilisés par les entreprises qui n’ont pas l’obligation de recourir à un commissaire aux comptes. Elles font parfois appel à un audit contractuel de leurs comptes par un professionnel, expert-comptable ou commissaires aux comptes. La lettre de mission délimite l’intervention, dans le respect des normes de travail et de la déontologie professionnelle.